2022年7月7日下午，国家卫生健康委医政医管局召开全国三级公立医院绩效考核工作视频会议，正式公布了2020年度全国三级公立医院绩效考核国家监测考核结果。南京市儿童医院在全国三级公立儿童专科医院中位列第6名，首次进入专科医院最优等A级，比2019年度进步5名，位列全省儿童专科医院第一。

与2019年相比，南京市儿童医院2020年度“国考”成绩有以下特点：第一，总分提升明显，进入A等级，进步较高。第二，医疗质量、运营效率、持续发展和满意度评价4个维度得分较上年度均有一定程度的提升，全面发展势头良好。

自2019年启动国家三级公立医院绩效考核工作以来，南京医科大学附属儿童医院全院上下高度重视，在院党委领导下，成立国家公立医院绩效考核领导小组，实现分管领导负责制，将国考指标纳入医院职能科室及临床业务科室综合目标考核，采用目标管理办法逐步提升医疗质量，四级手术人数全国排名第7，危急重症尤其新生儿救治能力在省内同行中名列前茅，有效的发挥江苏省儿童医学中心技术引领及辐射作用。